現代社会に潜む忍者たちの姿を描いた花沢健吾のコミック「アンダーニンジャ」を実写化したアクション。忍者組織「NIN」に所属する末端の忍者が、戦後70年以上にわたって暗躍する組織の動向調査を命じられる。メガホンを取るのは『赤ずきん、旅の途中で死体と出会う。』などの福田雄一。福田監督作『斉木楠雄のΨ難』などの山崎賢人、『もしも徳川家康が総理大臣になったら』などの浜辺美波らが出演する。

太平洋戦争終結後、日本に進駐したGHQは忍者組織の解体を命令したが、忍者は消滅することなく世界各国のさまざまな機関に潜伏し、現在も約20万人の忍者が暗躍しているという。忍者組織「NIN」に所属する末端忍者・雲隠九郎（山崎賢人）は、戦後70年以上にわたって地下に潜り続けてきたある組織の調査を命じられる。調べを進める九郎だったが、女子高生・野口彩花（浜辺美波）と共に忍者同士の戦いに巻き込まれていく。