願いと引き換えに過酷な運命と闘う魔法少女たちを描いたアニメシリーズで、『劇場版　魔法少女まどか☆マギカ［新編］叛逆の物語』の続編となる劇場版。主人公・鹿目まどかが超常的概念と化した世界を舞台に、まどかの意志を継いで魔獣と闘う暁美ほむらが、悪魔となって世界を作り変えようとする。総監督の新房昭之や監督の宮本幸裕など本シリーズに携わってきたスタッフが参加し、アニメーション制作もシャフトが担当。ボイスキャストには悠木碧、斎藤千和、喜多村英梨、野中藍、加藤英美里などが名を連ねる。

魔法少女たちが傷ついていく姿を悲観し、全ての魔女を生まれる前に消し去りたいとキュゥべえに願った鹿目まどかは、「円環の理」と呼ばれる超常的概念と化す。世界は魔女が存在しないものとして作り変えられ、まどかの意志を引き継いだ暁美ほむらは魔女に代わって現れた魔獣と闘い続けていた。しかし、ほむらは自分が魔女と化しつつあり、その世界が偽りの空間だということに気づく。